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【中國(guó)科學(xué)報(bào)】施一公團(tuán)隊(duì)深入解析核孔復(fù)合體結(jié)構(gòu)

日期:2020-04-07

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  非洲爪蟾細(xì)胞局部NPC的三維結(jié)構(gòu) 

   

   非洲爪蟾NPC細(xì)胞質(zhì)環(huán)整體結(jié)構(gòu) 

  近日,西湖大學(xué)施一公團(tuán)隊(duì)及合作者在bioRxiv接連發(fā)布兩篇預(yù)印本,解析了來自非洲爪蟾核孔復(fù)合體的胞質(zhì)環(huán)的近原子分辨率結(jié)構(gòu)以及環(huán)繞其的腔環(huán)結(jié)構(gòu)。(bioRxiv所有論文未經(jīng)同行評(píng)議)。

  核孔復(fù)合體(NPC)擔(dān)負(fù)著真核生物細(xì)胞核與細(xì)胞質(zhì)之間繁忙的運(yùn)輸大分子或顆粒物質(zhì)的任務(wù),也是其連接胞質(zhì)和細(xì)胞核的唯一雙向通道。解析NPC結(jié)構(gòu)有助于科學(xué)家了解蛋白和核酸進(jìn)出細(xì)胞的分子機(jī)制。

  非洲爪蟾是一種重要的模式生物。研究人員利用冷凍電鏡斷層成像技術(shù)(cryo-ET),分析了來自非洲爪蟾卵母細(xì)胞的NPC腔環(huán)的結(jié)構(gòu)。而且,所觀察到的腔環(huán)關(guān)鍵結(jié)構(gòu)特征,又通過單粒子冷凍電鏡技術(shù)(cryo-EM)分析得到了獨(dú)立驗(yàn)證。論文于3月29日發(fā)布。

  結(jié)果顯示,腔環(huán)包括8個(gè)蝶形亞基,每個(gè)包含兩個(gè)對(duì)稱翼。每個(gè)翼由4個(gè)細(xì)長(zhǎng)的管狀體組成。在腔環(huán)亞基內(nèi),8個(gè)原體形成了兩個(gè)結(jié)構(gòu)域,其中一個(gè)為Finger結(jié)構(gòu)域,該結(jié)構(gòu)與直接接觸在內(nèi)部核細(xì)胞膜和外部核細(xì)胞膜間的融合處;另一個(gè)為Grid結(jié)構(gòu)域,它是Finger結(jié)構(gòu)域的堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。

  兩個(gè)鄰近的腔環(huán)亞基間,通過翼的側(cè)面邊緣與對(duì)方相互作用,并由此形成了一個(gè)Bumper結(jié)構(gòu)域,似乎起著緩沖鄰近NPC的作用。研究揭示了以前不為人知的腔環(huán)特征,并且有助于解釋NPC的彈性性質(zhì)。

  在另一篇論文中,施一公等人則解析了非洲爪蟾NPC胞質(zhì)環(huán)的結(jié)構(gòu)。NPC具有結(jié)構(gòu)可塑性,僅在細(xì)胞質(zhì)環(huán)的局部分辨率達(dá)15 ?時(shí)才能被表征出來。研究人員使用單粒子cryo-EM分析了非洲爪蟾NPC細(xì)胞質(zhì)環(huán),得出結(jié)構(gòu)的平均分辨率5.5~7.9 ?。具體而言,結(jié)構(gòu)模型核心區(qū)域平均分辨率為5.5 ?,局部分辨率達(dá)到4.5 ?。論文發(fā)布于3月28日。

  研究人員表示,每個(gè)細(xì)胞質(zhì)環(huán)亞基中的兩個(gè)Y復(fù)合體不僅相互作用,還與來自側(cè)翼亞基的復(fù)合體相互作用,形成環(huán)狀支架。在每個(gè)細(xì)胞質(zhì)環(huán)亞基中,包含Nup358區(qū)域包裹著兩個(gè)Y復(fù)合體的莖,可能以此穩(wěn)定了支架。Nup205則連接兩個(gè)Y復(fù)合體的短臂,并與鄰近Y復(fù)合體的莖相聯(lián)系。而包含Nup214的區(qū)域使用一個(gè)延伸的卷曲螺旋將兩個(gè)Y復(fù)合體的Nup85連接起來,并延伸到NPC的軸向孔隙中。研究人員表示,這些結(jié)構(gòu)有助于人們洞悉NPC 組裝,為搭建原子分辨率的模型提供了指導(dǎo)。

  相關(guān)論文信息:https://doi.org/10.1101/2020.03.27.009381

  https://doi.org/10.1101/2020.03.27.009407

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